故事發(fā)生在“蜘蛛俠”打敗“綠色惡魔”的兩年后，彼得8226帕克遠(yuǎn)離自己摯愛的女友瑪麗8226簡，繼續(xù)過著平淡而充滿刺激的雙重生活，白天他依舊是溫文爾雅、有些木訥的大學(xué)生，晚上則化身成為擁無限超人力量、除暴安良的蜘蛛俠。不過彼得8226帕克卻越來越難以平衡這種雙重性格，周圍的人開始懷疑他的身份，甚至很多人對其開始猜疑和誤解，連一向慈祥的阿姨對他的異常舉動也顯出一份驚訝和不安……彼得8226帕克一直生活在矛盾中，他希望向瑪麗表白自己的愛戀，更希望能夠跟她坦誠自己的真實身份。另外，彼得發(fā)現(xiàn)好友哈里8226奧斯本對蜘蛛俠殺了他的父親，一直耿耿于懷，身陷仇恨，不可自拔6奧斯本對蜘蛛俠殺了他的父親，一直耿耿于懷，身陷仇恨，不可自拔…… 與此同時，一位被稱為“章魚博士”的天才科學(xué)家，為了讓自己可以在安全距離內(nèi)研究有輻射的能料，在自己的背后安裝了四只長長的機械手，做起實驗來方便不少，但是不料一場基因突變實驗失敗之后，這四只機械手就永久固定在他的背后，盤根錯節(jié)，眼花繚亂。而那場失敗的實驗也使得“章魚博士”的性格變得偏激和瘋狂，為了奪取權(quán)力和錢財，“章魚博士”耍出各種手段，讓他成為令蜘蛛俠最頭疼...