大明年間，在京城有一家太和醫(yī)館，醫(yī)館館主陳慕禪表面上是一個大夫，其實他是西廠的特務。這一天他臉戴面具身穿黑衣來到西廠總部，卻被廠公識破，挑了他的面具并射了他一箭。陳慕禪駕著馬車帶著夫人逃過了一撥又一撥殺手的追殺，最后夫妻二人被殺手逼到懸崖邊，二人無路可逃只好跳下懸崖。

陳慕禪夫妻倆的死訊傳到醫(yī)館，他們的女兒 陳安安(張子萱 飾)傷心的哭死過去了。大徒弟 朱一品(陳赫 飾)覺得師傅和師娘的死并不是意外，一定另有隱情。這時來了一個蒙著面的孕婦要朱一品給她接生，朱一品沒接生過孩子，他趕忙翻看醫(yī)書，等他想到了辦法卻發(fā)現(xiàn)孕婦不見了，桌子上卻留下了一個卷軸。他打開卷軸一看，里面記載著很多殺手的名字及其所用的武器。朱一品看完卷軸就暈了過去，卷軸也自燃化成了灰燼。

原來陳慕禪夫妻倆并沒有死，那個孕婦就是陳慕禪喬裝打扮的，這個卷軸是陳慕禪故意留給朱一品的，他希望朱一品能夠創(chuàng)造奇跡。看了醫(yī)館最后一眼，陳慕禪夫妻二人駕著馬車離開了京城。

朱一品醒過來以后就急忙去找陳安安，他告訴沉浸在悲傷中的安安師傅和師娘并沒有死，讓陳安安不要過于難過。陳安安不相信朱一品，朱一品告訴陳安安師傅給他留下的有信號。陳安安是個花癡，她提醒朱一品父親讓他照顧的不僅只有醫(yī)館還有自己，她要朱一品早日娶她為妻。朱一品說師傅和師娘現(xiàn)在生死不明，自己不可能和陳安安談婚論嫁。陳安安氣得把朱一品拍在桌子上。

朱一品剛出房間就被西廠特務 柳若馨(姜妍 飾)打暈了，他被帶到西廠總部。西廠廠公汪公公讓朱一品把卷軸的內容寫下來，朱一品說自己忘記了。柳若馨把朱一品帶到湖上的亭臺內，她抽出長劍逼朱一品說出卷軸的下落。朱一品卻認出了柳若馨的長劍就是卷軸中記載的武器龍鱗決。這時，有人在暗處用飛鏢攻擊二人，柳若馨用長劍把飛鏢打落，朱一品認出釘在墻上的飛鏢是卷軸上記載的殺手春三娘的武器。